لأغذية المُخمَّرة، أو تخمير الأغذية، هي تقنيةٌ لمعالجة الأغذية تُسخِّر نموَّ الكائنات الدقيقة ونشاطها الأيضي لضمان استقرار الأغذية وتحويلها. تاريخيًا، استُخدم التخمير بشكلٍ رئيسي لتثبيت المنتجات الزراعية القابلة للتلف. ومنذ ذلك الحين، تطوَّرت التكنولوجيا لتوسيع نطاق استخدام تخمير الأغذية ليتجاوز الحفظ، ليشمل تحسين خصائصها الحسية والوظيفية والتغذوية.